まずはトーン化するレイヤー以外を非表示にします

この状態でモノクロ２階調化

警告メッセージが出ますが、後で元に戻すのでそのまま続けます

ハーフトーンスクリーンを選択、入力と出力は同じにします

線数＝トーンの線数になります。この場合は60線のトーンと同様です。
角度は45度、網点形状は円にします。

選択範囲→すべてを選択

これをコピーしたら、ヒストリーでモノクロ２階調化前にアンドゥして・・・

ペーストして、レイヤー描画モードを乗算にします

これでグレースケール着色部分のトーン化は終了。
後は非表示にしていたレイヤーを表示させて、全体をモノクロ化します

モノクロ２階調→ハーフトーンスクリーンを選択までは同じですが、

今度は線数を出力と同じにします。これで原稿のモノクロ化は完了です。

グレースケールの柔らかい感じを出したい場合や、
鉛筆（汗）やコピックで着色してあるアナログ原稿の場合は
150線で（場合により線画部分ごと）トーン化（アミカケ風）するといいと思います。